Порт должен принимать во внимание переменную CFLAGS. Если он этого не делает, то, пожалуйста, добавьте в файл Makefile строчку NO_PACKAGE=ignores cflags.
Пример файла Makefile, в котором принимается во внимание переменная CFLAGS, приводится далее. Отметьте употребление символов +=:
CFLAGS += -Wall -Werror
А вот пример, в котором не учитывается значение переменной CFLAGS:
CFLAGS = -Wall -Werror
В системе FreeBSD переменная CFLAGS определена в файле /etc/make.conf. В первом примере к переменной CFLAGS добавляются дополнительные флаги, при этом сохраняются все определения, данные ранее на уровне системы. Во втором примере всё, что было задано ранее, игнорируется.